財政部昨(13)日預告修正適用所得稅協定查核準則，即所得稅協定查準，有關在他國居住者申請適用所得稅協定、退還溢扣繳稅款，期限將由現行的5年延長為10年。
資誠稅務法律服務副總經理邱奕銜說，按所得稅法規定，他國居住者取得我國來源的課稅所得，均應依法扣繳稅款或申報納稅。但他國如果與我國有簽訂租稅協定並生效，依規定可以適用較低稅率、甚至免稅。
另外，依照現行所得稅協定查準，他國居住者如在取得我國來源所得時沒有申請適用所得稅協定，可以在稅款繳納日起5年內，檢附文件向我國稅捐稽徵機關提出適用申請及退還溢繳稅款。
目前，財政部預告將申請期限由5年延長為10年，修正案有利納稅義務人；也符合行政程序法、稅捐稽徵法等有關人民公法上請求權時效10年的規定。
邱奕銜指出，此項草案中也訂定過渡條款，未來草案修正通過生效時，在生效日尚未滿5年的案件，申請適用協定期限可延長為10年；不過如已超過5年的案件，將無法適用修正後的10年期限。
邱奕銜同時提醒兩點。首先，申請適用所得稅協定退還溢繳稅款，可由所得人、扣繳義務人或其委託的境內個人或營利事業申請。常見申請所得類別，包括營業利潤、股利、利息、權利金或技術服務費等，分別適用免稅或所得稅協定規定的上限稅率。
其次，部分所得稅協定中另外定有適用規範，例如台灣與德國所得稅協定中規定，退稅申請必須在股利、利息、權利金或其他所得項目適用扣繳稅款所屬曆年度後的第4年底前提出，此時，則應優先適用4年的期限規定；餘依此類推。
